يعد من أقدم الجوامع في بيت لحم، وقد تم بناءه عام 1860 لذكرى الخليفة عمر بن الخطاب الذي زار بيت لحم عام 637 ميلادي في فترة الفتوحات العربية بعد أن أصدر مرسوماً تعهد فيه بسلامة جميع المسيحيين ورجال الدين واحترام مقدساتهم.  تم تجديد المسجد بالكامل عام 1955 خلال الحكم الأردني للمدينة.